Exadata gaat Erasmus MC ondersteunen bij DNA-onderzoek

VX Company levert derde Exadata databasemachine in Nederland.

VX Company voorziet het Erasmus Medisch Centrum (EMC) in Rotterdam van een Exadata databasemachine. Met de Exadata machine gaat het EMC flinke stappen maken in het DNA-onderzoek. De geavanceerde databasemachine vertienvoudigd de opslagcapaciteit en verkort query-responsetijden van gemiddeld 12 minuten naar enkele seconden.

Bert Grevelink, directeur van VX Company: ‘De overname van Sun Microsystems door Oracle heeft een super machine opgeleverd: Exadata, een geoptimaliseerde database infrastructuur, waarbij software en hardware zijn geïntegreerd in één apparaat. Exadata is een geavanceerde oplossing die met zijn extreme performance, professionele organisaties verder laat excelleren. VX Company is er erg trots op inmiddels al drie Exadata machines in Nederland te hebben afgeleverd.’

Prof. Dr. Peter van der Spek, hoogleraar bioinformatica van het Erasmus Medisch Centrum: ‘Het complexe onderzoek naar het menselijk DNA levert enorm veel data op. Een DNA uitlezen doen we in één dag. En niet één keer, we doen dat van dezelfde patiënt tussen de 40 en 80 keer. Dat levert ongeveer 1,5 TB aan data op. Uitgeprint levert dat een sliert papier op van 250 km lengte. Maak je een vergelijking met ‘gezond’ weefsel, of doe je erfelijkheidsonderzoek, dan levert dat nog eens een veelvoud aan data op.’

Van der Spek: ‘DNA-onderzoek is essentieel in de zoektocht naar een medicijn tegen kanker en andere ziektes en aandoeningen. Hiervoor is een professionele ICT-infrastructuur vereist. Om in onze specifieke IT-behoefte te voorzien, zijn wij in zee gegaan met de VX Company. Zij leverden ons de Exadata machine van Oracle, die er voor zorgt dat de tijd van queries drastisch wordt teruggebracht: van 12 minuten naar slechts enkele seconden. Ook onze opslagcapaciteit is enorm verhoogd, deze is met een factor tien toegenomen. Met deze investering is de kans op een medische doorbraak in het DNA-onderzoek weer een stap dichterbij gekomen.’

Erasmus MC is het grootste en wetenschappelijk meest toonaangevende Universitair Medisch Centrum van Nederland. Bijna 13.000 medewerkers werken binnen de kerntaken patiëntenzorg, onderwijs en wetenschap continu aan een verbetering en versterking van de individuele patiëntenzorg en de maatschappelijke gezondheidszorg. Zij ontwikkelen hoogwaardige kennis, dragen dit over aan toekomstige professionals en passen dit toe in de zorg voor patiënten. De komende vijf jaar wil Erasmus MC uitgroeien tot één van de beste medische instituten in de wereld.

Bron: VX Company